Computationele Biologie
- handboek
- videolessen
- Python bronnen
Na de deadline zal de computationele complexiteit (tijd en geheugen) van de volgende twee oefeningen geëvalueerd worden. Voor deze evaluatie komen enkel correcte oplossingen in aanmerking en wordt telkens de laatst ingediende correcte oplossing geëvalueerd.
| Title | Class progress | |||
|---|---|---|---|---|
| Pattern count | ||||
| Most frequent words | ||||
| Reverse complement | ||||
| Pattern occurrences | ||||
| Clump finding | ||||
| Minimum skew | ||||
| Hamming distance | ||||
| Approximate pattern matching | ||||
| Most frequent words with mismatches | ||||
| Most frequent words with mismatches and reverse complements | ||||
| Frequency array | ||||
| Pattern to number | ||||
| Number to pattern | ||||
| D-neighborhood |