Deze cursus is gearchiveerd · Deze cursus is nu afgesloten. Je kunt je niet meer registreren of nieuwe oplossingen indienen, maar je eerdere werk en resultaten blijven beschikbaar.

Computationele Biologie


Chapter 02: Which DNA patterns play the role of molecular clocks?
27 februari 2018 22:00

  • handboek
  • videolessen
  • Python bronnen
  • oefeningen waarvan computationele complexiteit zal gebenchmarked worden
    • Greedy motif search with pseudocounts (benchmark)
    • Gibbs sampler
Titel Voortgang groep
Motif enumeration
Distance between pattern and strings
Median string
Profile-most probable k-mer
Greedy motif search
Greedy motif search with pseudocounts
Randomized motif search
Gibbs sampler